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在臨床上約有三分之一胃食道逆流疾病患者，在使用二個月以上的陽離子幫浦阻斷劑治療後，症狀仍無明顯改善，稱為頑固型胃食道逆流疾病，臺北榮總內視鏡中心醫師王彥博表示，現在透過九十六小時無線食道酸鹼膠囊檢查，能夠更加準確地幫助藥物治療效果不佳的胃食道逆流疾病患者進行判斷。對於頑固型胃食道逆流疾病的民眾，需要考慮接受內視鏡或外科手術治療的胃食道逆流患者來說，接受二十四小時食道酸鹼值／阻抗檢查與食道動力學檢查（評估食道收縮蠕動的功能以及下食道括約肌的壓力變化），可確定有胃酸逆流的事實，給予更準確的診斷及適當治療，或較好的手術治療效果。王彥博指出，傳統食道酸鹼值檢查為二十四小時，需將一條細小導管，經鼻腔將管線置放於食道上，定位於適當位置後，將導管連接到一台手掌大的小型電腦，以測量食道中的酸鹼值，進而評估胃酸逆流情形以及逆流與患者症狀之關聯。這種方式會使部分病人感覺敏感，無法忍耐導管帶來的不適感，導致無法完成檢查；或在檢查中，沒有明顯逆流症狀，無法反應出平時不舒服的情形，都會影響到食道酸鹼值檢查的結果。北榮內視鏡中心引進的九十六小時無線食道酸鹼膠囊檢查，則是將酸鹼測定膠囊放入下端食道中，並固定於食道黏膜上，膠囊將偵測到的食道酸鹼值，透過無線傳輸的方式，傳送資料到體外的接受器中，最長可執行九十六小時的食道酸鹼檢查。檢查過程中，患者可維持正常的生活模式與飲食情形，醫師也可以根據患者九十六小時的食道酸鹼值結果與症狀與作息記錄，評估患者不適之原因。對於藥物治療效果不佳的胃食道逆流疾病患者，也可以在九十六小時的檢查中，依醫師指示服用相關治療藥物，用以比較評估病患服用藥物前後，對胃酸逆流以及症狀治療的效果。